Belajar Biokimia

1.      FUNGSI PROTEIN DIDALAM TUBUH

a.      Sbg Enzim

b.      Sbg Hormon

c.Sbg Alat Transpor Dalam Darah, Misalnya Transferrin : Transpor Zat Besi

d.      Ikut Mempertahankan Keseimbangan Asambasa

e.      Cairan Tubuh

f.      Sbg Antibodi

g.      Protein regulator (pengatur)

h.      Protein structural

2.      SENYAWA TERBANYAK DALAM SEL

Protein ;;> meskipun tubuh manusia pling bnyak terdiri dari air,,,namun pada keadaan sel kering, mngandung protein trbanyak

3.      Syarat  Asam amino penyusun protein

a.      Ggs asamnya hrus karboksilat

b.      Gugus as yg terikat dg atom C yg sama dngan gugus NH2

c.       AA hanya dari isomer L

d.      R’ pada struktur rumus umum hrus trtentu ( hnya 20 AA yang dptr mmbentuk protein)

4.      ASAM AMINO NON & ESSENSIAL , MUTLAK , RELATIVE ESSENSIAL

Semi essensial

a.      Arginin

b.      Histidine

Essential :

a.      Arginin

b.      Valine

c.       Leucine

d.      Lysine

e.      Isoleucine

f.        Penylalanine

g.      Methionine

h.      Histidine

i.         Treonine

j.         Tryptophan

Non Essential :

a.      Alanine

b.      Asparagine

c.       Aspartic acid

d.      Glycine

e.      Cystein

f.        Cystin

g.      Glutamic acid

h.      Glutamine,

i.         Serine

j.         Hydroxylysine,

k.       Hydroxyproline

5.      ASAM AMINO BERDASARKAN STRUKTUR KIMIA

A.     Asam amino non-polar

a.      Glisin

b.      Alanin

c.       Valin

d.      Leusin

e.      Isoleusin

f.        Prolin

B.      Asam amino polar

a.      Serin

b.      Threonin

c.       Sistein

d.      Metionin

e.      Asparagin

f.        glutamin

C.     Asam amino aromatic

a.      Fenilalanin

b.      Tirosin

c.       Triptofan

D.     Asam amino R (+)

a.      Lisin

b.      Arginin

c.       histidin  

E.      Asam R (-)

a.      Aspartat

b.      Glutamate

6.      ASAM AMINO YANG TIDAK TERDAPAT PADA PROTEIN

taurin

7.       ASAM AMINO BERFUNGSI

Asam Amino Basa

A.     Arginin (Arg)

a.      Zat Bakal Kreatin

b.      Dibentuk Pada Daur Urea Dari Ornithine

c.       Zat Bakal Nitric Oxide

B.      Lysin (Lys)

a.      Gugus Lys Berinteraksi Dgn Glutamin Ketika Faktor Xiiia Mengubah Polimer Fibrin Menjadi Bekuan Fibrin Yg Stabil

Asam Amino Yg Mengandung  S (Sulphur)

A.     Cystein (Cys)

a.      Menyediakan Gugus–Sh Bagi Glutation, Protein Pengangkut Asil (Acyl) Dan Koenzim A 

B.      Methionin (Met)

a.      S-Adenosil-Methionin ( “Methionin Aktif”) Merupakan Donor Metil Pada Reaksi Metilasi, Mis: Noradrenalin à Adrenalin

b.      Menyediakan S Untuk Biosintesis Cystein

Asam Amino Asam Dan Amidanya

A.     Glutamat

a.      Berperan Pada Katab. N Asam Amino (Transaminasi)

b.      Komponen Glutathion Dan Tetrahidrofolat

c.       Dekarboksilasi Pada Neuron à Gaba (Gamma Amino Butyric Acid)

B.      Glutamin

a.      Mengangkut Amonia Dari Jaringan Ekstrahepatik Ke Hati Dan Sphlanchnic Bed

b.      Ikut Dalam Biosintesis Nukleotida Purin

c.       Ikut Dalam Biosintesis Gmp

d.      Ikut Dalam Biosintesis Nukleotida Pirimidin

e.      Menghasilkan Ion Amonium Melalui Kerja Glutaminase Pada Respon Renal Terhadap Asidosis

f.        Reaksi Detoksifikasi Di Hati

g.      Zat Bakal Glutamat Dalam Neuron

h.      Bahan Bakar Utk Enterosit

C.     Aspartat

a.      Biosintesis Urea

b.      Biosintesis Nukleotida Purin

c.       Biosintesis Amp

d.      Biosintesis Nukleotida Pirimidin

e.      Berlaku Sebagai Neurotransmitter

D.     Asparagin

a.      Sintesis N-Linked Diogosakarida

8.      PROTEIN SEBAGAI TRANSPORTER

Transport zat tertentu : retinol binding protein, transport vit A, transferin pengangut besi, serum plasmin pengangkut tembaga, lipoprotein

9.      PENGERTIAN ENZIM, KOENZIM, APOENZIM, HALOENZIM

a.      Enzim adalah Katalisator organik yang secara kimia adalah protein, disintesis oleh sel, bekerja terutama di dalam sel, dapat juga di luar sel, mengkatalisis reaksi-reaksi nyang khas (spesifik).

b.      Apoenzim  adalah Enzim yang perlu faktor tertentu dengan BM yang lebih kecil dari unit aktif. (Faktor à koenzim/kofaktor)

c.       Koenzim adalah Molekul organik yang membantu kerja enzim

d.      Haloenzim adalah Gabungan apoenzim + faktor

e.      Metaloenzim adalah enzim yang mengandung logam

Ikatan koenzim dengan apoenzim yang sangat kuat disebut sebagai gugus prostetik

10.  VITAMIN SEBAGAI KOENZIM, KOFAKTOR

a.      THIAMIN / B1 Koenzim yang berasal dari Vit B1 adalah tiamin pirofosfat(TPP). Bekerja dalam dalam dua tipe, dekarboksilasi oksidatif asam-asam keto dan reaksi transketolase

b.      RIBOVLAVIN/B2 kompenen koenzim flavin mononukleotida (flavin mononucleotide, FMN) dan flavin adenine dinukleotida (adenine dinucleotide, FAD). Berperan aktif dalam rangkaian oksidoreduksi dalam organel mitokondria, dengan menerima H atau elektron  dari NADH dan menghasilkan air

c.       VITAMIN B12 Koenzim yang aktif Metil kobalamin dan Deoksiadenosin kobalamin

d.      Biotin ( sebagai koenzim pd berbagai reaksi korboksilasi )

e.      Asam pantotenat koenzim dari CoA

f.        SIANOKOBALAMIN / B6 dalam bentuk aktif sebagai koenzim adalah Piridoksal fosfat dan pyridoxamine fosfat. Berperan sebagai salah satu senyawa koenzim A yang digunakan tubuh untuk menghasilkan energi melalui jalur sintesis asam lemak, seperti spingolipid dan fosfolipid. Vit B6 banyak terdapat dalam otot sebagai koenzim glikogen fosforilase

g.      vitamin K juga berperan sebagai kofaktor enzim untuk mengkatalis reaksi karboksilasi asam amino asam glutamate

11.  ENZIM PETRANSFER GUGUS METIL

Sulfur untuk sintesis sistein berasal dari metionin. Kondensasi dari ATP dan metionin dikatalisis oleh enzim metionin adenosiltransfrease menghasilkan S-adenosilmetionin (SAM). 

Biosintesis S-adenosilmetionin (SAM)

SAM (S-adenosilmetionin ) merupakan precursor untuk sejumlah reaksi transfer metil (misalnya konversi norepinefrin menjadi epinefrin). Akibat dari tranfer metil adalah perubahan SAM menjadi S-adenosilhomosistein. S-adenosilhomosistein selanjutnya berubah menjadi homosistein dan adenosin dengan bantuan enzim adenosilhomosisteinase. Homosistein dapat diubah kembali menjadi metionin oleh metionin sintase.

12.  VITAMIN LARUT LEMAK SEBAGAI KOENZIM

Vitamin K

13.  Klasifikasi enzim

Nomenklatur à 6 Golongan Enzim

a.      Oksidoreduktase

b.      Transferase

c.       Hidrolase

d.      Liase

e.      Isomerase

f.        Ligase

A.     Oksidoreduktase

§  Mengkatalisis reaksi oksidasi-reduksi antara 2 substrat

                               E

                  AH2 + B à AH + BH2

¡  transfer H antara 2 substrat

2. Transferase

¡  Mengkatalisis transfer gugus antara 2 substrat

                              E

§  AG + B à A + BG

§  Ex. transaminase, transmetilase

3. Hidrolase

§  Mengkatalisis reaksi hidrolisis ikatan kovalen dengan H₂

                        E   

¡  A + B à AH + BOH

                   H2O

¡  Ex. Peptidase, esterase, glukosidase,  amilase, fosfatase

4. Liase

¡  Memecah ikatan kovalen (seperti hidrolase) tetapi tanpa  H2O dan menghasilkan ikatan rangkap/gas

                  E

¡   -C-C-        à  -C=C-  +  x – y      (Aldolase)

                    x   y

                                E

¡   -C-C = O à - C – H + CO2 (Dekarboksilase)

                  y OH           y                

5. Isomerase

¡  Mengkatalisis perubahan satu isomer ke isomer lain

¡  Fosfoheksosa isomerase

                                  E

¡  Glukosa 6P à Fruktosa 6P

6. Ligase/sitetase

¡  Mengkatalisis pembentukan ikatan kovalen :

                  - C – C –

                  - C – N –

                  - C – O –

14.  TETAPAN MICHAELIS MENTEN 

17.  UNTUK MENGIKAT O_{2 ,} CA, MG. CU 

1. Zn

a.      Anhidrase karbonat (seluruh tubuh, SDM, tubulus  ginjal, sel HCl lambung)

b.      Karboksi peptidase (sel epitel lambung)

c.       Alkohol dehidrogenase (ragi)

2. Cu

a.      Oksidase à jar pernafasan

b.      seroplasmin à protein serum à proses oksidasi

3. Se

Peroksidase à melindungi tubuh dari oksidasi berlebihan

4. Mo

Xantin oksidase dan nitrogenase

5. Fe

a.      Langsung terikat : Non-heme Iron Protein

b.      tidak lansung terikat : berikatan dengan senyawa organik (porfirin) à Fe-Porfirin (Hem) à Hemoglobin

6. Mg²⁺ à kinase, pada kinase Mg selalu berikatan dengan substrat sumber fosfat yaitu ATP
7. Ca²⁺ à enzim proses penggumpalan darah
8. K⁺ à piruvat kinase (dengan Mg)
9. Na⁺ à enzim sukrase (usus)

Logam, memacu aktifitas enzim: Mg, Mn, Co, Fe

Logam berat, menghambat aktivitas enzim: Pb, Cu, Zn, Cd, Ag

18.  Disosiasi H₂O dipengaruhi oleh

19.  PROTEIN YG TERDAPAT DALAM PLASMA

a.      Hemoglobin   64.500

b.      Albumin          69.000 ( 57% ), menjaga tekanan osmotik koloid

c.       Globulin        ( 40% ), terdiri dari α1, α 2, ß , γ globulin.berperan dlm kekebalan tubuh

a)      β1 –Globulin         90.000

b)     γ—Globulin          156.000

c)      α1-Lipoprotein     200.000

d)     β1-Lipoprotein      1.300.000

d.      fibrinogen       340.000 ( 3% ) mengandung faktor-faktor koagulasi

                                                               i.      Semua di sintesa di Hati, kecuali γ globulin di limfosit dan plasma sel.

e.      kadar protein total dalam plasma 7—7,5 g/dl

20.  SERUM

cairan berwarna kuning supernatan yg terdpt pd darah yg mengalami koagulasi, Tidak mengandung :

a.      fibrinogen

b.      faktor koagulasi ( f. II, f.V , f. VIII )

21.  HB TERDIRI DARI

a.      4 rantai polipeptida yang masing-

b.      masing mengikat heme,

c.       tiap heme mengikat 1 atom Fe,

d.      tiap Fe mengikat 1 molekul O₂

22.  KALAU DARAH TIDAK DIBERIKAN APAPUN MAKA APA YANG AKAN TERJADI

a.      Fibrinogen berubah menjadi fibrin bila darah membeku

b.      Darah bila keluar akan membeku → cairan jernih disebut SERUM

c.       Darah bila diberi antikoagulan dipusingkan → terdapat cairan kuning di atas  disebut Plasma

d.      Serum → Plasma + fibrinogen

e.      Bekuan darah → fibrinogen (protein yang larut dalam plasma) → fibrin (tidak larut)